東晉安帝義熙年間（405～418），廢皖縣置懷寧縣，屬晉熙郡；隋初廢郡置州，晉熙郡更名為熙州，懷寧縣屬熙州；大業(yè)三年（607），屬同安郡；唐武德四年（621），同安郡更名為舒州；天寶元年（742）改舒州為同安郡；至德二年（757）改同安郡為盛唐郡；乾元元年（758）改盛唐郡為舒州，懷寧縣屬之；北宋至道三年（997），屬淮南路；政和五年（1115），屬德慶軍。

南宋紹興十七年（1147），改德慶軍為安慶軍；慶元元年（1195），升安慶軍為安慶府，懷寧縣屬安慶府管轄；元至元十四年（1277），安慶府更名為安慶路。

明初安慶路更名為寧江府；洪武六年（1373），寧江府更名為安慶府，懷寧縣先后屬之；清順治二年（1645），屬江南省安慶府；十八年（1661），屬江南左布政使司安慶府；清康熙六年（1667），改江南左布政使司為安徽布政使司；乾隆二十五年（1760），安徽布政使司自江寧移治安慶府，懷寧屬安慶府；1912年，懷寧縣直屬安徽�。�1914年，屬安慶道；1928年8月，直屬安徽省；1932年，建立行政督察專員公署，屬第一專區(qū)；1945年抗日戰(zhàn)爭(zhēng)勝利后，屬安慶專區(qū)；1946年仍屬第一專區(qū)；中華人民共和國(guó)初期，設(shè)皖北、皖南行署，屬皖北行署；1952年7月，成立安徽省，屬安徽省安慶專區(qū)；1970年，屬安慶地區(qū)；1988年，安慶地區(qū)、安慶市合并成新的安慶市，屬安慶市管轄至今。