金天德三年（1151），于潞縣治設(shè)州，取“漕運(yùn)通濟(jì)”之意稱通州，潞縣屬之。

元升漷陰縣為州稱漷州。

明洪武十三年（1380），漷州降為縣，稱漷縣。

1914年改州為縣，始稱通縣。

1948年底，通縣全境解放，隸屬通縣專區(qū)。

1958年3月7日國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，將河北省通縣劃歸北京市。

1958年5月29日國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，撤銷通縣和通州市，合并成立通州區(qū)。

1960年1月7日國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，撤銷通州區(qū)，恢復(fù)通縣。

1997年4月29日，《國(guó)務(wù)院關(guān)于同意北京市撤銷通縣設(shè)立通州區(qū)的批復(fù)》國(guó)函〔1997〕30號(hào)，撤銷通縣，設(shè)立通州區(qū)。

2020年下轄17個(gè)街道鄉(xiāng)鎮(zhèn)。

2022年，下轄11個(gè)街道辦事處，11個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)。