南宋時,因塘中小嶼曾稱:蓮花嶼之來歷,故明末清初時,沿塘被雅稱為蓮嶼。
直至民國33年(1944年)保甲制時,蓮嶼屬青陽鄉(xiāng)蓮嶼保。
建國后,1956年屬青陽鎮(zhèn);1959年屬青陽公社蓮嶼大隊;1960年由蓮嶼大隊拆出部份居民,組成蓮嶼居委會;1980年屬青陽鎮(zhèn)蓮嶼大隊;1984年改為青陽鎮(zhèn)蓮嶼村委會,(1992年10月間,三行拆出成立霞行村委會)2004年青陽鎮(zhèn)撤銷蓮嶼村委會劃歸青陽街道與蓮嶼居委會整合為蓮嶼社區(qū)居委會。