六鰲宋代屬安仁鄉(xiāng)含恩里。

元代設(shè)青山巡檢司。

明代屬十五都。

明洪武二十一年（1388年）設(shè)陸鰲守御千戶所，屬于軍事編制，隸屬鎮(zhèn)海衛(wèi)。

陸鰲守御千戶所人口屬于軍籍，明代前期對抗御倭寇入侵起到重要作用。

至康熙十八年“復界”，許多村民沒有回居陸鰲，人口大減。

康熙三十九年重新編定保甲，陸鰲、龍澳二保并編為龍鰲一保。

民國初年實行“里鄰”制度，全半島編為六鰲里，初屬東區(qū)管轄，后劃屬第一區(qū)（區(qū)署設(shè)在舊鎮(zhèn)）。

1940年設(shè)六鰲鄉(xiāng)，轄下營、城江、鰲西、鰲東、大澳、龍南、龍北7保。

1944年，龍南龍北并為龍美保，大澳改為墩澳保。

新中國初期，六鰲屬第四區(qū)(舊鎮(zhèn)區(qū))，1952年改屬第九區(qū)（深土區(qū)），分為鰲中、下寮、頂大澳、龍美4鄉(xiāng)。

1958年3月合為六鰲鄉(xiāng)，9月改屬深土公社，設(shè)六鰲管理區(qū)。

1961年7月成立六鰲公社，1984年9月政企分開，改為六鰲鄉(xiāng)。

1992年2月六鰲鄉(xiāng)改六鰲鎮(zhèn)并沿用至今。