水口營(yíng)村村民多姓商，始祖商祿公，朱明皇朝右承相徐達(dá)麾下之將士，來自北京河澗府（又名河間府）滄州南皮縣北隅七圖三角堤村。

洪武十二年（1404年），商祿公與副官許諒率部駐守廣州北部禺北冬瓜窿（當(dāng)時(shí)花都屬古番禺治下）。

其時(shí)，元亡世亂，群雄四起，新政當(dāng)權(quán)，不少地方盜賊四起，禺北地區(qū)，萬山環(huán)峙，山深谷窈，口隘林叢，常為盜匪聚集之地。

商祿公奉命率部駐守，常與盜匪廝殺，許諒殉職，商家因軍功也襲而食皇祿。

至清兵入關(guān)，商氏家族已世襲九代，早已不是最初的野戰(zhàn)部隊(duì)編制。

清順治四年（1667年），順治改革前明軍功世襲俸祿制，但仍允許商氏家族于駐地辟地屯居，取良田自耕自食，以商氏第九代傳人商大賓入籍番禺屯稅，居水口屯（今水口營(yíng)）。

五六十年代建社時(shí)曾稱德星，七十年復(fù)原稱。

按所在地水口營(yíng)村而命名。

1987年1月，北興區(qū)公所成立水口營(yíng)村委會(huì)，隸屬北興區(qū)公所。

1987年3月，隸屬北興鎮(zhèn)人民政府。

2005年2月，依據(jù)粵民區(qū)[2005]10號(hào)文件，水口營(yíng)村歸由花東鎮(zhèn)管轄，并沿用至今。