蕉嶺縣舊稱鎮(zhèn)平縣。

春秋戰(zhàn)國時屬“百越之地”。

秦始皇三十三年（前214），秦始皇發(fā)兵平南越，設南海郡，蕉嶺地屬南海郡龍川縣。

漢高后呂雉五年（前183），分龍川縣為龍川、揭陽兩縣，蕉嶺地屬揭陽縣。

三國吳（222-280），蕉嶺地屬東官郡，仍屬揭陽縣。

晉太康元年（280），改東官郡為義安郡，仍屬揭陽縣。

東晉咸和六年（331），蕉嶺地屬義安郡之海陽縣。

南朝齊高帝建元元年（479），分海陽縣為海陽、程鄉(xiāng)兩縣，蕉嶺地屬程鄉(xiāng)縣。

南朝陳武帝永定元年（557），設潮州，以程鄉(xiāng)、海陽、潮陽屬之。

五代南漢乾和三年，置敬州，領程鄉(xiāng)縣。

宋太祖開寶四年（970年），改敬州為梅州，蕉嶺地屬梅州。

元世祖至元十九年（1282），升梅州為梅州路。

明太祖洪武二年（1369），廢梅州路，復稱程鄉(xiāng)縣，隸屬潮州府。

明嘉靖四十三年（1564），置平遠縣，隸潮州。

蕉嶺之置城地址古懷仁及其最富庶之石窟河平原，均屬平遠縣地。

明崇禎六年（1633），設置鎮(zhèn)平縣，隸屬潮州。

清雍正十一年（1733），升程鄉(xiāng)為嘉應州，領平遠、鎮(zhèn)平、興寧、長樂四縣。

清嘉慶十二年（1807），嘉應州為嘉應府。

清嘉慶十七年（1812），仍改為州，是為嘉應州鎮(zhèn)平縣。

1912年，中華民國成立后，廢嘉應州，鎮(zhèn)平縣隸屬廣東省直轄。

1914年，因河南省已先有“鎮(zhèn)平縣”，而更名為“蕉嶺縣”。

1949年5月14日，蕉嶺縣解放，6月，蕉嶺縣人民民主政府成立，隸屬興梅專區(qū)。

1952年，撤銷興梅專區(qū)，蕉嶺縣隸屬粵東行政公署。

1952年8月，蕉嶺與平遠合縣，稱蕉平縣。

1954年3月，蕉平分縣，仍稱蕉嶺縣。

1956年2月，成立汕頭專署，撤銷粵東行署。

蕉嶺縣改隸屬汕頭專區(qū)。

1958年12月，蕉嶺與梅縣合并，稱梅縣。

1961年3月，蕉梅分縣，恢復蕉嶺縣建置。

1965年7月1日，梅縣專區(qū)從汕頭專區(qū)分出，成立梅縣地區(qū)，蕉嶺縣隸屬于梅縣地區(qū)。

1988年1月，撤銷梅縣地區(qū)，成立梅州市，蕉嶺縣隸屬梅州市管轄，一直沿用至今。