據(jù)查在秦代時期隸屬于南�？し兀鬂h、三國時期隸屬于惠州署博羅縣，東晉咸和六年至唐至德二年隸屬惠州署寶安縣，唐至德二年至明萬歷元年隸屬東莞縣，明萬歷元年至清康熙五年，隸屬于新安縣，清康熙五年至清末又劃規(guī)為東莞縣管轄，中華人民共和國成立前夕改為寶安縣管轄。
1949年10月至1951年11月屬惠陽縣第四區(qū)，1951年12月至1958年3月為惠陽縣大鵬鄉(xiāng)，1958年11月至1983年7月屬寶安縣大鵬公社，1983年10月至1993年1月屬寶安縣南澳鎮(zhèn)，今為深圳市龍崗區(qū)南澳街道。
1992年春成立南澳居委會。
2004年8月，經(jīng)龍崗區(qū)政府批準(zhǔn)轉(zhuǎn)為深圳市龍崗區(qū)南澳鎮(zhèn)南澳社區(qū)居民委員會，名稱沿用至今。