夏商春秋時為鳛國地。
戰(zhàn)國后期屬巴郡符縣。
秦隸巴郡、蜀郡。
西漢屬犍為郡符縣(治今四川合江縣)。
東漢為鳛部地。
魏晉屬江陽郡符縣。
隋屬瀘川郡合江縣。
唐貞觀十六年(642)中東部屬溱州,儀鳳二年(677)分屬淅州(治今四川淅川縣)、藺州(治今四川古藺縣)。
北宋大觀三年(1109)屬滋州。
南宋宣和三年(1121)廢州,改為武都城。
元屬古滋長官司。
明洪武四年(1371)屬永寧長官司。
明萬歷二十九年(1601)屬仁懷縣。
清道光二十年(1840)遵義府經(jīng)移駐溫水,稱溫水府經(jīng)。
1914年設(shè)溫水分縣,屬赤水縣兼管。
1915年設(shè)鳛水縣,縣衙駐溫水,隸黔中道。
因轄境有鳛水河,故以此為縣名。
翌年(1916)縣衙遷駐官渡(今赤水市官渡鎮(zhèn))。
1935年屬第五行政督察區(qū)。
1949年屬遵義專區(qū)。
1950年縣人民政府遷溫水,1951年4月遷東皇。
1959年改鳛水縣為習(xí)水縣。
1964年簡化為習(xí)水縣。
1965年12月析長沙、官渡2區(qū)歸赤水縣,劃赤水縣土城、醒民、隆興3區(qū)及仁懷縣永安、桑木、回龍3區(qū)入轄。
1990年屬遵義地區(qū)。
1997年,屬遵義市。
2015年,全縣由23個鄉(xiāng)(鎮(zhèn))設(shè)為4個街道20鎮(zhèn)2鄉(xiāng),政府駐地變更至杉王街道。