1959年，西沙群島、南沙群島、中沙群島辦事處設(shè)立，由海南行政區(qū)管轄。

1988年，西沙群島、南沙群島、中沙群島辦事處劃歸新成立的海南省管轄。

2012年6月21日，民政部公告宣布，國務(wù)院正式批準(zhǔn)，撤銷西沙群島、南沙群島、中沙群島辦事處，建立地級三沙市，西沙群島、中沙群島由三沙市直轄。

2020年4月18日，中華人民共和國民政部發(fā)布公告，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，海南省三沙市設(shè)立南沙區(qū)。

三沙市南沙區(qū)管轄南沙群島的島礁及其海域。