清康熙二十二年（1683），清政府在黑龍江左岸舊璦琿設置黑龍江將軍衙門，1685年，黑龍江將軍所遷至江右岸璦琿。

1913年，建立璦琿縣。

1946年4月1日，恢復了黑河地區(qū)行政辦事處。

7月24，愛輝縣政府歸并于黑河地區(qū)行政辦事處。

9月16日，撤消黑河行政辦事處，成立了黑河行政區(qū)督察專員公署。

1956年，以璦琿二字生僻難認，改為愛輝縣。

1980年底，黑河鎮(zhèn)、幸福公社、西崗子煤礦、東方紅煤礦從愛輝縣分出，建立黑河市。

1983年6月，愛輝縣并入黑河市。

1993年3月，原黑河地區(qū)行署改建制為黑河市（地級），原黑河市（縣級）改建制為愛輝區(qū)，成為新黑河市唯一的市轄區(qū)，原行政區(qū)劃不變，史稱兩撤兩建。

名稱沿用至今。