清宣統(tǒng)元年（1909），清廷照準(zhǔn)，于臨江州東境烏蘇里江附近設(shè)置綏遠(yuǎn)州，隸屬吉林行省東北路道管轄。

1913年1月23日，綏遠(yuǎn)州改稱綏遠(yuǎn)縣。

1914年6月，隸屬依蘭道（東北路道改稱）。

1929年2月撤銷道制，由吉林省直轄。

同年9月27日，因與山西省綏遠(yuǎn)縣重名，綏遠(yuǎn)縣改稱撫遠(yuǎn)縣。

1934年12月劃歸偽三江省管轄。

1938年將饒河縣撓力河以北地區(qū)劃歸撫遠(yuǎn)縣管轄。

1947年隸屬合江省。

1949年5月，劃歸松江省管轄。

1951年4月，撤銷撫遠(yuǎn)縣建制，改設(shè)撫遠(yuǎn)漁業(yè)特區(qū)。

同年6月，將撓力河以北之東安鎮(zhèn)等地劃歸饒河縣管轄。

1952年8月，恢復(fù)撫遠(yuǎn)縣。

1954年8月松、黑兩省合并后，隸屬黑龍江省合江地區(qū)。

1959年4月，將富錦縣同江區(qū)（包括同江、三村、樂業(yè)3個鄉(xiāng)）劃歸撫遠(yuǎn)縣管轄，并將同江區(qū)改為同江鎮(zhèn)，撫遠(yuǎn)縣人民委員會由撫遠(yuǎn)鎮(zhèn)移駐同江鎮(zhèn)。

1965年，將西部的同江鎮(zhèn)和樂業(yè)、三村、街津口、八岔公社及勤得利農(nóng)場鄉(xiāng)劃歸新設(shè)置的同江縣管轄，撫遠(yuǎn)縣人民委員會遷回?fù)徇h(yuǎn)鎮(zhèn)。

1985年1月1日，劃歸佳木斯市領(lǐng)導(dǎo)，由黑龍江省直接管轄。

2016年1月15日，撤銷撫遠(yuǎn)縣，設(shè)立撫遠(yuǎn)市（縣級），名稱沿用至今。