雍正十三年（1735）清政府開辟茂興至呼蘭的軍事道。
清乾隆元年(1736)七月，清廷批準(zhǔn)，設(shè)立烏蘭諾爾站(今肇源縣新站鎮(zhèn))至呼蘭城驛路，于此設(shè)察布奇爾臺(tái)，依序?yàn)榈诙_(tái)站，故稱“二站"。
清光緒三十一年（1905），于二站添設(shè)郭爾羅斯后旗巡防局，翌年改設(shè)肇州廳，移駐“駱駝脖子”。
1906年改為肇州廳，并遷往肇源城。
1913年郭爾羅斯后旗設(shè)置二站鄉(xiāng)。
1945年“九三”抗日戰(zhàn)爭勝利后，1946年設(shè)置二站區(qū)，1949年改為第三區(qū)。
1956年3月，設(shè)置二站鄉(xiāng)。
同年4月，改隸肇源縣。
1958年9月，將福興鄉(xiāng)并入改稱二站人民公社。
1961年將原福興鄉(xiāng)劃出，成立福興公社。
1984年3月，將二站公社改為二站鄉(xiāng)。
1985年5月，改設(shè)二站鎮(zhèn)。