五棵樹鎮(zhèn)在清乾隆年間屬吉林將軍府伯都訥廳。
民國屬榆樹縣六區(qū)五棵樹保。
二十世紀(jì)三四十年代屬五棵樹村。
1946年,屬榆樹縣第六自治區(qū)。
1948年,屬榆樹縣第十三區(qū)。
1956年,分為五棵樹鎮(zhèn)和正義鄉(xiāng)。
1959年,改五棵樹公社。
1961年4月,分為前進(jìn)、劉家、太平、五棵樹四個(gè)公社。
1964年,分為松花江公社和五棵樹鎮(zhèn)。
1969年,松花江公社改名五棵樹公社。
1983年,五棵樹公社改濱江鄉(xiāng)。
1985年,濱江鄉(xiāng)并入五棵樹鎮(zhèn)。
2001年,前進(jìn)鄉(xiāng)并入五棵樹鎮(zhèn)。