馬家灣自然科學院舊址位于延安市寶塔區(qū)橋溝鎮(zhèn)馬家灣村北大修廠院內。
自然科學院的前身是自然科學研究院。1939年5月,為了保證陜甘寧邊區(qū)工業(yè)生產的發(fā)展,促進同防、經濟建設,中共中央決定在延安創(chuàng)辦自然科學研究院。1939年底,在中央財經部召開的自然科學討論會上,一些專家學者提出以現(xiàn)有的科技人員為師資,自然科學研究院為基地,成立自然科學研究院。1940年1月,中共中央決定將自然科學研究院改為工、農、科性質的教育機構——自然科學院。院長由李富春兼任,副院長陳康白,學院屬中央財經部領導。1940年9月1日,自然科學院舉行開學典禮。1941年1月,學院改屬中央文委領導,徐特立接任院長。1941年9月,又開辦了醫(yī)訓班,一年半后轉入醫(yī)科大學。1941年12月年底,中央規(guī)定:“延安大學、魯迅藝術學院、自然科學院為培養(yǎng)黨與非黨的各級高級與中級專門的政治、文化、科學及技術人才的學校。”1943年10月,學院從馬家灣遷到東川橋兒溝,與延安大學、魯藝正式合并,成為延安大學的一個學院。
1945年8月,抗戰(zhàn)勝利后,中共中央決定將自然科學院向東北地區(qū)轉移。11月15日,自然科學院從延安出發(fā)。到張家口后,由于形勢變化,決定暫留當地,改名為晉察冀邊區(qū)工業(yè)專門學校。1948年,與北方大學工學院合并,定名為華北大學工學院。1949年遷到北京。1952年1月1日,改稱北京工業(yè)學院(今北京理工大學)。