清道光二十三年（1843年），金州廳在長山列島設(shè)置島區(qū)（即金州16島）。

清光緒三十一年（1905年），日俄戰(zhàn)爭以后，淪為日本殖民地。

民國三十四年（1945年）11月，解放，建立鄉(xiāng)（區(qū)）人民政權(quán)，先后屬新金縣、金縣、長海（長山）縣。

1950年8月，獐子區(qū)為長山縣第四區(qū)。

1955年6月，第四區(qū)改稱獐子區(qū)。

1956年3月，獐子區(qū)改為獐子大耗、小耗、搭槌4鄉(xiāng)，直屬旅大市長海縣。

1958年6月，4鄉(xiāng)合并為獐子鄉(xiāng)。

同年10月，建獐子公社。

1983年9月，撤社建鄉(xiāng)，為獐子鄉(xiāng)。

1985年5月，撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，隸屬未變。

2009年10月，獐子鎮(zhèn)改稱獐子島鎮(zhèn)。