1949年后稱旗溝村,屬徽縣第六區(qū)管轄;1958年公社化后,旗溝村改為旗溝大隊,屬大門公社;1983年公社改鄉(xiāng)后,旗溝大隊改為旗溝村,設旗溝村民委員會,屬蘇成鄉(xiāng);2003年12月撤銷蘇成鄉(xiāng)并入汪川鎮(zhèn)至今。