明代（1368—1644年），金華鎮(zhèn)境屬貴陽軍民府、貴州衛(wèi)管轄置，有上賣糕堡、下賣糕堡、何官堡。

清代（1636—1912年），屬貴陽府貴筑縣西上里范圍。

民國三年（1914年），廢貴陽府置貴陽縣，屬貴陽縣口。

民國二十年（1931年），金華鎮(zhèn)、上賣糕鄉(xiāng)、下賣糕鄉(xiāng)、蒼坡鄉(xiāng)、下視鄉(xiāng)、翁貢鄉(xiāng)、翁井鄉(xiāng)、集賢鄉(xiāng)、何官鄉(xiāng)屬貴陽縣第六區(qū)范圍。

民國三十年（1941年），貴陽撤縣設(shè)市，原貴陽縣更名貴筑縣，縣政府移屬貴筑縣，轄地包括白云區(qū)金華保、翁貢保、何官保、狗場保、虎洞保、翁井保、下視鄉(xiāng)。

1949年11月，今金華鎮(zhèn)隸貴筑縣白云區(qū)金華鄉(xiāng)。

1951年3月，廢除保甲制，建小行政村，貴筑縣第五區(qū)（金華區(qū)）轄金龍、虎洞、翁井、富芝、下視、何官、倉坡、翁貢等小行政村。

1952年，貴筑縣劃分為11個區(qū)，今金華鎮(zhèn)屬第五區(qū)金華鄉(xiāng)、蒿芝（塘）鄉(xiāng)、三鋪、栗木鄉(xiāng)范圍。

1955年4月，今金華鎮(zhèn)劃屬貴陽市郊區(qū)，屬金華區(qū)三鋪、栗木、金龍、蒿芝（塘）范圍。

1958年2月，貴陽市建花溪、烏當兩郊區(qū)，屬今金華鎮(zhèn)烏當區(qū)。

同年7月，今鎮(zhèn)境內(nèi)建金龍、三鋪、蒿芝、下羔、上視等5個農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社。

年底，廢鄉(xiāng)置火箭人民公社。

1960年，火箭、星火、紅旗3個人民公社合并建立金華人民公社。

1983年，撤銷人民公社，恢復鄉(xiāng)鎮(zhèn)體制，生產(chǎn)大隊改建為村民委員會。

春秋時期（前770年—前478年），鎮(zhèn)境屬詳舸國轄地。

戰(zhàn)國時期（前475年—前221年），屬荊楚之范圍，兩漢時期隸屬夜郎樣舸郡。

唐朝時期（618—907年），在烏江以南設(shè)羈縻州，屬矩州。

宋代（960—1279年），稱貴陽為貴州。

宣和元年（1119年），更矩州為貴州，屬貴州。

元至元十七年（1280年），置順元路宣撫司，翌年改為順元路宣慰司，鎮(zhèn)境屬順元路宣慰司。

元至元二十年（1283年），置貴州等處長官司，為順元路宣慰司治，先隸屬四川行中書省，后隸屬湖廣行中書省。

元至元二十九年（1292年），順元路宣慰司與八番宣慰司合并，鎮(zhèn)境屬八番順元路宣慰司。

明洪武四年（1371年），鎮(zhèn)境屬貴州宣慰使司。

明萬歷二十九年（1601年），鎮(zhèn)境屬貴陽軍民府。

清康熙二十六年（1687年），改貴陽軍民府為貴陽府鎮(zhèn)境屬貴陽府。

民國三年（1914年），廢貴陽府設(shè)貴陽縣，鎮(zhèn)境屬貴陽縣。

民國三十年（1941年），撤貴陽縣設(shè)貴陽市，另置貴筑縣，鎮(zhèn)境屬貴筑縣。

1949年11月15日，貴陽解放，同年11月23日成立貴陽市人民政府。

1954年，貴筑縣劃歸貴陽市管轄。

1958年，撤貴筑縣建置，將市郊劃為花溪、烏當兩區(qū)，朱昌鎮(zhèn)屬烏當區(qū)管轄。

2001年10月，貴陽市政府在野鴨鄉(xiāng)、金華、陽關(guān)一帶建設(shè)金陽新區(qū)。

2008年，朱昌鎮(zhèn)由烏當區(qū)劃歸金陽新區(qū)管轄。

2012年12月，貴陽市金陽新區(qū)正式命名為觀山湖區(qū)，朱昌鎮(zhèn)屬觀山湖區(qū)。

民國三十二年（1943年），為五里鄉(xiāng)。

1953年，分為五里、桂花兩個鄉(xiāng)。

1958年，為三屯、中心、桂花三個生產(chǎn)管理區(qū)。

1961年，為五里公社。

1963年，分出桂花公社。

1967年，分出云歸公社。

1984年，為百花湖鄉(xiāng)。

1992年，由原五里區(qū)百花湖鄉(xiāng)和云歸鄉(xiāng)合并為百花湖鄉(xiāng)。

2011年11月15日，從清鎮(zhèn)市劃出，隸屬觀山湖區(qū)。

2017年7月，貴州省政府同意撤銷觀山湖區(qū)百花湖鄉(xiāng)，設(shè)立百花湖鎮(zhèn)。