天聰八年(1634年)劃定旗界。
清順治五年(1648年)建立旗制,設(shè)札薩克衙門,會(huì)盟昭烏達(dá)。
雍正初年(1723年)屬熱河廳,雍正十一年(1733年),屬承德府八溝理事同知廳。
乾隆四十三年(1778年)屬熱河道赤峰縣。
中華民國前期屬熱河特別區(qū),偽滿時(shí)屬偽興安西省,改札薩克衙門為偽旗公署。
中華民國34年(1945年)10月,建立旗政府。
中華民國36年(1947年),建巴林右翼旗人民政府,屬熱河省昭烏達(dá)盟人民政府轄。
1949年5月,隨昭烏達(dá)盟歸內(nèi)蒙古自治區(qū),轄5個(gè)努圖克、2個(gè)區(qū)。
1952年,行政區(qū)劃變更為1個(gè)區(qū),5個(gè)努圖克。
1954年,巴林右翼旗人民政府改建為巴林右翼旗人民委員會(huì)。
1957年,更名為巴林右旗人民委員會(huì),同年,撤努圖克、區(qū)改建蘇木、鄉(xiāng),轄9個(gè)蘇木、8個(gè)鄉(xiāng)。
1958年,改建為10個(gè)人民公社。
1961年,增建到14個(gè)人民公社。
1968年,改建為巴林右旗革命委員會(huì)。
1969年,隨昭烏達(dá)盟劃歸遼寧省。
1979年,隨昭烏達(dá)盟復(fù)歸內(nèi)蒙古自治區(qū),復(fù)建巴林右旗人民政府。
1983年,盟改市,屬赤峰市轄。
1984年,改建為15個(gè)蘇木、2個(gè)鄉(xiāng),2個(gè)鎮(zhèn)。
2001年,將原來的19個(gè)蘇木鄉(xiāng)鎮(zhèn)調(diào)整為12個(gè)蘇木、2個(gè)鄉(xiāng)、2個(gè)鎮(zhèn)。
2006年,撤鄉(xiāng)并鎮(zhèn),由16個(gè)蘇木鄉(xiāng)鎮(zhèn)合并組建為3個(gè)蘇木、5個(gè)鎮(zhèn)。
2012年,行政區(qū)劃調(diào)整,將查干沐淪鎮(zhèn)劃分為查干沐淪蘇木和巴彥琥碩鎮(zhèn)。
巴林右旗人民政府駐大板鎮(zhèn),轄西拉沐淪、巴彥塔拉、幸福之路、查干沐淪4個(gè)蘇木、大板、索博日嘎、寶日勿蘇、查干諾爾、巴彥琥碩5個(gè)鎮(zhèn),沿用至今。