該鎮(zhèn)民國時期為惠民縣第三區(qū)。

1955年9月全縣轄區(qū)地名統(tǒng)改稱謂，更名石廟區(qū)。

1956年12月石廟區(qū)分化為石廟、龐家、青陽店、于王四個鄉(xiāng)。

1958年2月區(qū)劃調整，石廟、龐家、青陽店、于王四個鄉(xiāng)又合并為石廟鄉(xiāng)。

1958年11月建立人民公社時，更名為石廟公社。

1961年石廟公社更名石廟區(qū)，下轄于家寨、青陽店、孟家等7個公社。

1969年9月全縣撤區(qū)改社，復名石廟公社。

1971年析其東部地區(qū)置梁家公社。

1984年全縣撤銷人民公社建鄉(xiāng)鎮(zhèn)，石廟公社更名石廟鄉(xiāng)，梁家公社更名梁家鄉(xiāng)。

1985年石廟鄉(xiāng)更名石廟鎮(zhèn)。

2001年3月撤銷梁家鄉(xiāng)，其行政區(qū)域劃入石廟鎮(zhèn)。