夏商屬雍州。
殷商晚期,為北方部族鬼方領(lǐng)地。
春秋為白狄族居地。
秦漢屬上郡膚施、陽(yáng)周2縣。
北魏太和十一年(487)設(shè)朔方縣,屬東夏州朔方郡。
隋先后分屬雕陰郡綏德、城平、延?h。
西魏大統(tǒng)初于今縣西北折家坪附近設(shè)綏德郡,大統(tǒng)十二年(546)置綏德縣為郡置。
隋開(kāi)皇三年(583)郡廢,隋末縣廢。
唐武德元年(618)分屬并州道綏州城平、延福;貞觀九年(635)置渾州、寬州,后合并設(shè)為寬州。
北宋初屬陜西路、永興軍路城平縣。
康定元年(1040)筑土城,宋仁宗賜名青澗,元豐七年(1084)設(shè)青澗城,屬永興路綏德軍。
金大定二十二年(1182)青澗城升為青澗縣,隸鄜延路綏德州。
蒙古至元四年(1267)懷寧縣并入青澗。
元屬延安路綏德州。
明洪武四年(1371)改為清澗縣,屬延綏鎮(zhèn)榆林道;崇禎十六年(1643)改為天波府。
清順治二年(1645)復(fù)稱清澗縣。
雍正三年(1725)綏德州升為直隸州,清澗縣屬直隸州。
1913年屬陜西省榆林道。
1926年廢道,為省直轄縣。
1936年1月建立陜北省清澗縣蘇維埃政府。
1940年成立清澗縣人民政府,屬綏德分區(qū)。
1949年5月,隸屬陜北行署綏德分區(qū)。
1950年1月,屬陜西省綏德分區(qū)所轄。
1956年10月隸榆林專區(qū)。
1958年12月,并入綏德縣,1959年3月,清澗成為中心鄉(xiāng),仍隸榆林專區(qū)綏德縣。
1961年,恢復(fù)清澗縣,屬榆林地區(qū)行政公署管轄。
2000年,榆林地區(qū)改為榆林市,清澗縣屬榆林市轄縣。
2001年,撤銷寨溝鄉(xiāng),并入解家溝鎮(zhèn),撤銷東拉河鄉(xiāng),并入李家塔鎮(zhèn)。
轄石嘴驛、折家坪、解家溝、店則溝、高杰村、李家塔、玉家河、師家園則8鎮(zhèn),郝家墕、樂(lè)堂堡、下二十里鋪、雙廟河、老舍窠、二郎山、石盤7鄉(xiāng)和秀延街道辦事處。
2011年7月7日,二郎山鄉(xiāng)并入解家溝鎮(zhèn),郝家墕鄉(xiāng)并入石咀驛鎮(zhèn),樂(lè)堂堡鄉(xiāng)并入寬州鎮(zhèn),撤銷秀延街道辦事處。
轄石嘴驛、折家坪、解家溝、店則溝、高杰村、李家塔、玉家河、師家園則8鎮(zhèn),下二十里鋪、雙廟河、老舍窠、石盤4鄉(xiāng),有639個(gè)村民委員會(huì)和4個(gè)居民委員會(huì)。