1951年，屬巴中縣興隆鄉(xiāng)管轄。

1958年，設(shè)立鳳凰廟管理區(qū)，又稱第一管區(qū)。

1962年，更名為鳳凰廟生產(chǎn)大隊(duì)，簡(jiǎn)稱鳳凰廟大隊(duì)，又稱一大隊(duì)。

1969年，更名為鳳凰廟大隊(duì)革命委員會(huì)。

1981年，復(fù)名鳳凰廟生產(chǎn)大隊(duì)。

1984年，全國(guó)實(shí)行政社分設(shè)，撤銷鳳凰廟生產(chǎn)大隊(duì)，設(shè)立鳳凰廟村村民委員會(huì)，簡(jiǎn)稱鳳凰廟村村委會(huì)。

1993年，屬巴中市（縣級(jí)）興隆場(chǎng)鄉(xiāng)管轄。

2000年，屬巴中市巴州區(qū)興隆場(chǎng)鄉(xiāng)管轄。

2013年，屬巴中市恩陽(yáng)區(qū)興隆場(chǎng)鄉(xiāng)管轄。

2016年，屬巴中市恩陽(yáng)區(qū)興隆鎮(zhèn)管轄。

2020年，村級(jí)建制調(diào)整，將龍頂村5組、金鴨村1組、鳳凰廟村2、3、4、5組合并，設(shè)鳳凰廟村。