清乾隆二十四年（1759）在精河東岸筑城取名“安阜”設典史。

二十六年（1761）安阜城增設都司，管理軍事。

三十六年（1771）吐爾扈特部東歸，一部分安置于此。

光緒十四年（1888）設精河直隸撫民廳，隸伊塔道。

1913年直隸廳改設精河縣，隸屬伊塔道。

1929年隸屬伊犁行政區(qū)。

1950年屬伊犁專區(qū)，全縣下設3區(qū)、11鄉(xiāng)。

1954年7月，博爾塔拉蒙古自治區(qū)成立，精河縣隸博爾塔拉蒙古自治區(qū)。

1955年2月，博爾塔拉蒙古自治區(qū)改稱博爾塔拉蒙古自治州，隸屬不變。