漢代屬西域都護府下轄的捐毒國。

唐屬疏勒都督府。

清乾隆二十三年（1758），始屬喀什噶爾。

光緒九年（1883）屬疏附縣管轄。

1913年，設烏魯克恰提分縣。

1929年10月27日，從疏附縣析置烏魯克恰提設治局，治所在今烏魯克恰提鄉(xiāng)政府駐地。

1938年，正式建縣，定名烏恰縣，縣政府駐黑孜葦，隸屬喀什行政區(qū)。

1954年7月，劃歸克孜勒蘇柯爾克孜自治區(qū)。

1955年10月，克孜勒蘇柯爾克孜自治區(qū)改為克孜勒蘇柯爾克孜自治州。

1985月8月23日，發(fā)生7.4級強烈地震，老縣城被毀。

后在距老縣城東邊6千米處的博魯什戈壁灘新建縣城。

1989年10月17日縣城遷入現址。