2001年3月得名。

解放初，菜園屬一區(qū)。

1958年人民公社化時屬城郊公社，1959年為城郊（金星）公社菜園管理區(qū)，1961年至1963年撤公社改區(qū)，管理區(qū)改為小公社為城郊區(qū)菜園小公社，1969年至1970年6月，區(qū)又改成公社，小公社改為大隊為城郊公社菜園大隊，1979年，從菜園大隊劃出光明大隊，1984年設區(qū)建鄉(xiāng)，光明并入菜園鄉(xiāng)，屬寶頂區(qū)，1988年撤區(qū)建鄉(xiāng)為城郊鄉(xiāng)菜園村公所；2000年改革農(nóng)村村級管理體制，撤銷村公所設村委會，為菜園村民委員會，2001年3月，將城郊鄉(xiāng)管轄的菜園建制村劃歸云鶴鎮(zhèn)管轄，為云鶴鎮(zhèn)菜園村民委員會，名稱沿用至今。