西漢建元六年（前135年），置堂瑯縣（今巧家、會澤、東川一帶），始有縣治，屬犍為郡。

西漢元鼎六年（前111），改稱三絳縣，屬越嶲郡。

東漢永初元年（107），稱堂瑯縣，屬犍為郡國。

三國蜀漢屬朱提郡。

西晉屬益州。

東晉屬寧州。

南朝齊屬南朱提郡。

唐南詔為閟畔部駐地，置東川郡，屬拓東節(jié)度。

宋代東川郡直屬大理。

元初設閟畔萬戶府，至元十五年（1291）改閟畔軍民總管府，至元二十八年（1291）東川郡改置東川路。

明洪武十五年（1382）改為東川府，改屬四川布政司。

清順治十六年（1659）東川土府內附。

清康熙三十八年（1699）“改土歸流”設東川府。

清雍正四年（1726）復屬云南。

雍正五年（1727）置會澤縣，治巧家，六年移至今址。

1913廢府存縣，屬滇中道，1916年廢道，直屬省。

1922年恢復會澤縣名。

1947年屬第二行政督察區(qū)。

1949年屬第一行政督察區(qū)。

1950年5月18日會澤縣人民政府成立，屬昭通專區(qū)。

1958年10月1日撤會澤縣并入東川市。

1964年12月15日恢復會澤縣，改隸曲靖專區(qū)，1997年5月6日，曲靖地區(qū)撤地設市，會澤縣隸屬于曲靖市。