蒼南原為平陽縣之部分。

古為百越之地，春秋戰(zhàn)國時屬越國。

秦統(tǒng)一六國后，屬閩中郡。

此后，數(shù)易歸屬。

至西晉太康四年（283），析安固縣南橫嶼船屯置始陽縣。

平陽設(shè)縣始此，不久更名橫陽縣。

后又幾經(jīng)撤并，至五代后梁乾化四（914），更名平陽。

以平陽為縣名始此。

原屬平陽縣。

1981年析平陽縣的礬山鎮(zhèn)和靈溪、宜山、錢庫、橋墩、金鄉(xiāng)、礬山、馬站７個區(qū)72個人民公社設(shè)蒼南縣，因地處玉蒼山之南而得名。

《讀史方輿紀(jì)要》卷九十四：“玉蒼山，在（平陽）縣西南八十里，亦名八面山，山周百余里，跨峙八鄉(xiāng)，稍北，巖岫四圍，只通一門�！睋�(jù)傳昔產(chǎn)玉，故名“玉倉”。

后諧音異寫作“玉蒼”。

此后，歷經(jīng)多次鄉(xiāng)鎮(zhèn)撤并。

2019年，撤銷蒼南縣龍港鎮(zhèn)，設(shè)立縣級龍港市，形成今之政區(qū)范圍。