明永樂三年（1405）合東林、西林，改名雙林鎮(zhèn)。

1949年屬吳興縣稱雙林鎮(zhèn)，同年秋撤鄉(xiāng)建區(qū)屬雙林區(qū)。

1950年春屬雙林區(qū)稱雙林鎮(zhèn)。

1958年10月，雙林鎮(zhèn)稱雙林人民公社。

1961年5月，經(jīng)嘉興地委批準雙林鎮(zhèn)為吳興縣直屬鎮(zhèn)。

1967年10月至1969年9月，雙林組建革命委員會。

1975年雙林鎮(zhèn)成立區(qū)工委，下轄雙林鎮(zhèn)、苕南、莫蓉、鎮(zhèn)西、重兆、塘南6個社區(qū)。

1981年撤縣建市（撤吳興縣，建立湖州市），建立了各公社管理委員會和雙林鎮(zhèn)人民政府制度。

1983年撤嘉興專區(qū)，湖州市升格為地級市，實現(xiàn)市管縣（區(qū)）體制。

雙林屬郊區(qū)直管，郊區(qū)下設(shè)6個分區(qū)委，雙林分區(qū)委下轄雙林鎮(zhèn)、苕南、莫蓉、鎮(zhèn)西、重兆、塘南。

1984年實行行政社分設(shè)，公社管理委員會改為鄉(xiāng)政府，大隊改為村。

1993年撤小區(qū)建大區(qū)，撤南潯、雙林、練市三區(qū)，建立南潯區(qū)管理委員會。

同年苕南并入雙林鎮(zhèn)，雙林開始歸屬南潯區(qū)管理委員會管轄。

1999年鎮(zhèn)西、莫蓉二鄉(xiāng)并入雙林鎮(zhèn)。

2003年撤南潯區(qū)工委建立南潯區(qū)政府，雙林鎮(zhèn)屬南潯區(qū)政府管轄至今。